3er Workshop en Bioinformática y Bioestadística en Genómica
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El mismo se llevará a cabo en la Universidad Nacional de Córdoba, en conjunto con la Universidad Católica de Córdoba y el MinCyT – CBA.
Expositores:
- Dr. Fabio Lima Custodio (LNCC – Brasil)
- Dr. Dr. Vinicius Maracaja-Coutinho (U. Chile, Chile)
- Dr. Elmer A. Fernández (CIDIE – UCC – CONICET. Argentina)
- Mgs. Diego Llarul (Heritas, Argentina)
- Dra. Romina Girotti (IBYME – CONICET – Argentina)
Conferencias confirmadas:
- Rol de la bioinformática en el estudio de respuestas a inmunoterapias en melanoma
- Protein structure prediction: from physical to data models
- Modelos Lineales para la predicciòn del contenido inmunológico en tumores
Cursos Confirmados de Posgrado:
- From sequence to neoantigens
Dictado por:
Emilio Fenoy, Ibel Carri (Instituto de Investigaciones Biotecnológicas (IIB-INTECH) Nilsen Lab.
Desarrolladores del NetMHC, NetMHCPan y MuPeXi
Dr. Fabio Custodio (LNCC – Brasil) Experto en CNN networks y en Modelado de Proteinas
Juan Carlos Vazques (BDMG – CIDIE – UCC). Desarrollador de MODApy (Multi Omics Data Analysis in Python) Paquete para facilitar el analisis de variantes
Lunes 25 : 14:30 to 18:00
– Generalidades de NGS
– Introducción a linux
– Formato FASTA-FASTQ. Análisis de calidad de secuencias.
– Formato SAM. Mapeo a genoma de referencia.
Martes 26 : 14:30 to 18:00
– Formato VCF. Detección de SNP, SNV e INDELs con GATK. Visualización con IGV.
– MODApy: a filtering and annotation VCFs Tool for Variant Analysis (Juan Carlos Vazquez)
Miércoles 26: 9:00 to 12:00 and 14:30 to 18 (Emilio, Ibel, and Fabio)
– Introduction to Protein Structure Prediction
– Predicción de variantes inmunogénicas con MuPeXi. Priorización de neopéptidos candidatos.
Jueves: 9 to 12:00 and 14:30 to 17 (Fabio)
-Introduction to Deep Learning and its application to neoepitope prediction
Para más información:
Elmer A. Fernández (Bioing. PhD)
Investigador Independiente CONICET – Independent Research CONICET
CIDIE – CONICET
tel: +54-(0)351-4938000 int 145
Fax: +54-(0)351-4938081
Investigador Independiente CONICET – Independent Research CONICET
CIDIE – CONICET
tel: +54-(0)351-4938000 int 145
Fax: +54-(0)351-4938081
